การบริหารงานของเทศบาลเป็นการบริหารงานในรูปแบบนายกเทศมนตรีโดยตรง
      ปัจจุบัน นายมาชัย ไพศาลธนสมบัติ ปลัดเทศบาลนครนนทบุรี

เป็นผู้บังคับบัญชา พนักงานเทศบาล และลูกจ้างเทศบาล รองจากนายกเทศมนตรี รับผิดชอบควบคุม ดูแลราชการประจำของเทศบาลให้เป็นไปตามนโยบาย และมีอำนาจหน้าที่อื่น ตามที่กฎหมายกำหนดหรือตามที่นายกเทศมนตรีมอบหมาย

โดยมีรองปลัดเทศบาล เป็นผู้ช่วยเหลือตามที่ได้รับ
มอบหมายจากปลัดเทศบาล 3 คน คือ

      1. นางสุรีรัตน์ กณาพันธุ์ รองปลัดเทศบาล
      2. นายศราวุธ ธรรมแสง รองปลัดเทศบาล
      3. นางอริสา ขำชัยภูมิ รองปลัดเทศบาล